136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2868 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  881    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  53.38 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  41.29 
 
 		 412 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  35.28 
 
 		 407 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  38.28 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.92 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  35.59 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  33.81 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  36.6 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  36.88 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  32.94 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  33.41 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  34.62 
 
 		 430 aa  193  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  35.39 
 
 		 431 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  33.02 
 
 		 419 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  34.62 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  33.95 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  33.09 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  37.22 
 
 		 417 aa  176  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  33.51 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  33.59 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  30.37 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  33.07 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  37.58 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  31.33 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  32.99 
 
 		 415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.66 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  32.59 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  30.57 
 
 		 415 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  31.15 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  32.65 
 
 		 415 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  34.49 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  31.4 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  30.71 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  31.38 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  31.39 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.97 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  32.75 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.54 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  31.36 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  33.17 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  31.82 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  31.59 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  31.23 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  30.98 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  28.78 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  29.83 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  30.39 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  25.49 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  27.88 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  27.87 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  24.76 
 
 		 435 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  30.74 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.58 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  24.75 
 
 		 433 aa  90.5  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.44 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  27.8 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  27.65 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.98 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  30.09 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.74 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  25.38 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  29.67 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.39 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  26.87 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  25.75 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.46 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.46 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.9 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.88 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.3 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  25.3 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.31 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  37.4 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.03 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  30.26 
 
 		 152 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  27 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.69 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  25.76 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.67 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  25.13 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.25 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  30.25 
 
 		 362 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  27.41 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.68 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  29.63 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  30.59 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  27.41 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  30.38 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  29.55 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  33.82 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  29.55 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  27.27 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  26.9 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>