93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4363 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  929    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  93.62 
 
 
424 aa  833    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  63.84 
 
 
429 aa  581  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  39.72 
 
 
411 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  39.82 
 
 
418 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  32.13 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  33.67 
 
 
380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  32.3 
 
 
431 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  29.98 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  29.98 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  33.1 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  31 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  29.91 
 
 
419 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  30.14 
 
 
419 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  28.38 
 
 
430 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  29.67 
 
 
392 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  28.38 
 
 
435 aa  143  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 
419 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.15 
 
 
430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  28.31 
 
 
435 aa  136  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  30 
 
 
429 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  29.13 
 
 
433 aa  133  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.56 
 
 
432 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  27.21 
 
 
433 aa  126  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  28.35 
 
 
434 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.69 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.11 
 
 
433 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  34.3 
 
 
295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  26.75 
 
 
426 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  27.1 
 
 
412 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  26.22 
 
 
409 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  27.48 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.46 
 
 
407 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  27.23 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  28.38 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  27.96 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  26.17 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  28.77 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  25.75 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  24.36 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  23.67 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  26.37 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  25.69 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  27.03 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  23.6 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  26.39 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  26.88 
 
 
420 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  25.51 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  26.37 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  26.55 
 
 
460 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  54.72 
 
 
120 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  24.35 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.93 
 
 
441 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  30.77 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.37 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  26.39 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  26.15 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  26.01 
 
 
435 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  28.29 
 
 
421 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  24.75 
 
 
419 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  24.5 
 
 
405 aa  60.1  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  24.61 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  26.72 
 
 
420 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  24.75 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  26.74 
 
 
430 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  26.88 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  27.11 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  24.8 
 
 
440 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  24.01 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.23 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  24.53 
 
 
435 aa  50.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  29.95 
 
 
431 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  25.79 
 
 
430 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  28.95 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  25.37 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  33.07 
 
 
617 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  26.89 
 
 
453 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.37 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  36.45 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  31.72 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  26.21 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  36.14 
 
 
460 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  40 
 
 
434 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  42 
 
 
433 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.86 
 
 
434 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  42 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  42 
 
 
433 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  42 
 
 
433 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  42 
 
 
433 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  44 
 
 
433 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.86 
 
 
434 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  30.07 
 
 
433 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>