103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1467 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  100 
 
 
433 aa  900    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  59.15 
 
 
433 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  48.94 
 
 
435 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  48.22 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  45.97 
 
 
430 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  44.47 
 
 
432 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  40.32 
 
 
433 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  39.16 
 
 
439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  42.08 
 
 
429 aa  326  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  40.8 
 
 
434 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  42.42 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  40.29 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  38.63 
 
 
426 aa  300  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.94 
 
 
419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  31.3 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  28.94 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.92 
 
 
431 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  30.05 
 
 
444 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  29.09 
 
 
418 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  28.01 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  28.01 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.06 
 
 
391 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  29.28 
 
 
419 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  29.23 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  27.51 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  27.21 
 
 
449 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  29.06 
 
 
411 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  31.73 
 
 
429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  31.43 
 
 
295 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  26.96 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  24.65 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  25.54 
 
 
407 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  24.63 
 
 
412 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  26.78 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  24.24 
 
 
412 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.92 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  25.38 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  28.83 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  26.16 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  27.36 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  25 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  28.51 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  30.41 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  25.49 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  30.43 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  26.18 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  25.06 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  25.86 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  37.76 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  23.98 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  24.69 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  25.97 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  24.48 
 
 
429 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  23.05 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  25.86 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.18 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  36.84 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  30 
 
 
434 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  26.35 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  27.19 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  24.86 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  23.56 
 
 
418 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  26.96 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  24.27 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  23.33 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  24.75 
 
 
431 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.3 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  31.36 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  30.13 
 
 
410 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  31.53 
 
 
152 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  26.98 
 
 
405 aa  56.6  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  31.07 
 
 
120 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  23.38 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  23.87 
 
 
408 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  22.74 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  27.37 
 
 
305 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  23.03 
 
 
405 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  31.48 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  24.09 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  26.55 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  26.96 
 
 
318 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.34 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  25.41 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  24.39 
 
 
390 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  21.02 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  20.83 
 
 
460 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.49 
 
 
435 aa  46.6  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.84 
 
 
434 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  19.35 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  24.34 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  25.78 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.43 
 
 
434 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  30.6 
 
 
431 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  30.3 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  26.28 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  25 
 
 
447 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.63 
 
 
434 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>