127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2958 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 431 aa  867    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  56.44 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  36.55 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  39.27 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  36.76 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  34.93 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  35.59 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  32.51 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  30.89 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  33.12 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  31.41 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  34.45 
 
 		 420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  31.81 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  34.77 
 
 		 387 aa  161  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  34.16 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  31.16 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  30.71 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  33.77 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  30.73 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  33.51 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  31.74 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  29.81 
 
 		 404 aa  140  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  29.66 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  28.49 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  30.11 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  30.66 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  31.51 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  34.24 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.88 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  31.56 
 
 		 415 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  30.95 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  32.9 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  32.27 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  31.38 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  27.85 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  28.73 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  32.26 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  28.12 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  29.98 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  29.29 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  30.38 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.51 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  28.87 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  29.12 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  28.73 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.8 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  29.93 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  26.94 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  24.76 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.94 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  28.76 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  26.33 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  28.57 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  25.76 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  22.92 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.5 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.16 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.29 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  31.51 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  29.38 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  24.57 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  37.4 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  27.64 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  24.17 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  28.36 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  24.75 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  27.46 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  30.26 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  30.65 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  28.8 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.26 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  23.47 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.18 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  26.02 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.84 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.84 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  30.11 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  28.95 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  25.93 
 
 		 317 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  23.44 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  29.69 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  25.4 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  23.97 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.02 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  29.15 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  26.39 
 
 		 431 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  25.55 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  28 
 
 		 318 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  30.41 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.76 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.34 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  27.73 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.66 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  32.54 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  26.04 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.34 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>