138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1974 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  76.83 
 
 		 410 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  834    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  50.49 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  38.65 
 
 		 441 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  37.05 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  36.13 
 
 		 435 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  35.22 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  35.07 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  34.92 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  35.38 
 
 		 415 aa  212  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  33.41 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  33.8 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  35.56 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  36.92 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  35.77 
 
 		 415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  37.34 
 
 		 414 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  32.3 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  31.42 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  36.05 
 
 		 420 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  37.17 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  35.84 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  32.82 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  34.82 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  36.98 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  36.47 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  33.07 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  33.23 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  31.4 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  32.76 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  31.88 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  30.98 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  29.95 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  29.44 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  32.04 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  31.61 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  31.83 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  31.98 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  29.12 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  29.55 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  34.64 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  31.04 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  30.96 
 
 		 430 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  30.49 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  33.25 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  30.79 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  28.92 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  30.92 
 
 		 407 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  30.26 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  31.82 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.35 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  31.54 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  27.52 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  27.88 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.27 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  29.97 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  29.69 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  29.69 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  31.58 
 
 		 152 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.81 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  25.91 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  24.6 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  27.59 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.92 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  27.75 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  27.27 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  25.98 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  35.71 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  26.91 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  28.99 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.5 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  31.72 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  27.54 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  32.35 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.65 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  25.65 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  25.66 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  26.88 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  27.21 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  25.7 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  24.66 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  26.87 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  26.39 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  29.52 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  29.7 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  29.7 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  26.5 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  29.7 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  29.7 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  30.43 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  32.59 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  30.94 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  29.03 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  26.2 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  28.25 
 
 		 305 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  29.56 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  23.35 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.93 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  30.47 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  25.15 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>