184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2931 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  865    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  64.79 
 
 
430 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  62.23 
 
 
440 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  62.59 
 
 
430 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  60.19 
 
 
440 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  63.29 
 
 
387 aa  485  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  61.98 
 
 
387 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  47.09 
 
 
420 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  43.72 
 
 
411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  33.01 
 
 
412 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  33.58 
 
 
412 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  35.26 
 
 
435 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  32.52 
 
 
435 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  33.57 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  33.02 
 
 
430 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  31.84 
 
 
407 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  34.01 
 
 
460 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  32.51 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  35.51 
 
 
420 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  36.46 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  36.46 
 
 
415 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  30.41 
 
 
330 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  33.14 
 
 
418 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  32.72 
 
 
415 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  31.38 
 
 
429 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  30.05 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  33.87 
 
 
414 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  34.32 
 
 
435 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29.93 
 
 
407 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  30.51 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  33.13 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  28.94 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  32.09 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  31.01 
 
 
434 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  30.37 
 
 
409 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  29.82 
 
 
425 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  31.85 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  31.61 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  30.05 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  29.73 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  31.95 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  26.43 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  30.35 
 
 
414 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  32.08 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  32.13 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  30.06 
 
 
410 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  29.51 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  27.5 
 
 
414 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  31.03 
 
 
414 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  30.26 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.87 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  27.42 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  24.88 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.14 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.15 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.36 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  24.58 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.62 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  23.95 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  28.53 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  26.18 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.25 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.67 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.95 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  23.39 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  23.17 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  26.54 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  23.83 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  23.1 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  27.66 
 
 
419 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  24.92 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  24.12 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  24.62 
 
 
424 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.2 
 
 
433 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.32 
 
 
454 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  26.74 
 
 
433 aa  63.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  30.23 
 
 
460 aa  63.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 
433 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  23.86 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  28.19 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  31.37 
 
 
312 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  26.33 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  26.33 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 
435 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.67 
 
 
433 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  24.75 
 
 
449 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 
430 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  34.9 
 
 
438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  34.9 
 
 
438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  27.27 
 
 
431 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 
423 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  26.36 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  29.75 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.81 
 
 
433 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  27.45 
 
 
480 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  27.4 
 
 
295 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.61 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>