48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5379 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  888    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  100 
 
 		 438 aa  888    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  37.02 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  33.11 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  34.95 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  30.65 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  32.62 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  31.56 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  29.97 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  32.36 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  29.02 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  34.9 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0258  hypothetical protein  34.21 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000478609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.1 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  23.64 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  30.54 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  27.05 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  27.95 
 
 		 312 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  29.95 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  32.43 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  28.23 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  29.67 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  24.82 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  29.41 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30.37 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  26.07 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  31.03 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  29.43 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  28.37 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  25.53 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  25.82 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  22.99 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.26 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  27.04 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  29.55 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  23.86 
 
 		 425 aa  46.6  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  25.73 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  24.76 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  22.5 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  21.22 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  27.97 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  31.61 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  26.67 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  31.54 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.65 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  26.02 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  26.02 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  30.56 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>