20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3170 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  937    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  48.03 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  48.91 
 
 		 448 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  46.44 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  47.49 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  47.17 
 
 		 457 aa  359  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  35.42 
 
 		 436 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  32.35 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  32.28 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  29.97 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  29.97 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  23.32 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0258  hypothetical protein  36.84 
 
 		 141 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000478609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  26.47 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  28.36 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  31.25 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  39.02 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 		 420 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  23.3 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  22.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>