17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3691 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  936    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  64.14 
 
 
448 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  63.44 
 
 
456 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  61.69 
 
 
448 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  58.22 
 
 
457 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  47.4 
 
 
455 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  36.82 
 
 
436 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  31.28 
 
 
426 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  28.79 
 
 
430 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  29.02 
 
 
438 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  29.02 
 
 
438 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  23.43 
 
 
431 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0258  hypothetical protein  32.26 
 
 
141 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000478609  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  26.36 
 
 
451 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  29.57 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  24.34 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  33.01 
 
 
431 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>