29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2916 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  100 
 
 
448 aa  921    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  68.43 
 
 
456 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  64.14 
 
 
449 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  62.58 
 
 
448 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  57.78 
 
 
457 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  48.03 
 
 
455 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  39.25 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  32.19 
 
 
430 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  32.8 
 
 
426 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  32.62 
 
 
438 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  32.62 
 
 
438 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  26.45 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  27.41 
 
 
451 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  26.18 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  26.63 
 
 
431 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0258  hypothetical protein  34.02 
 
 
141 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000478609  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  23.83 
 
 
418 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  36.25 
 
 
431 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  27.27 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.15 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  28.28 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  32.5 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  22.98 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  30.67 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  24.87 
 
 
435 aa  43.5  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  25.71 
 
 
419 aa  43.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  28.71 
 
 
405 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>