147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3717 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  100 
 
 
435 aa  872    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  53.38 
 
 
430 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  42.58 
 
 
412 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  36.04 
 
 
420 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  33.58 
 
 
440 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  35.05 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  32.78 
 
 
430 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  32.84 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  34.07 
 
 
430 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  37.53 
 
 
429 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  32.52 
 
 
419 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  36.47 
 
 
420 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  33.98 
 
 
407 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  36.13 
 
 
417 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.82 
 
 
412 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  36.86 
 
 
407 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  35.58 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  34.15 
 
 
460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  34.38 
 
 
431 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  35.19 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  34.33 
 
 
411 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  34.6 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  31.27 
 
 
330 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  33.1 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  31.79 
 
 
404 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  32.94 
 
 
415 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  33.41 
 
 
431 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  31.68 
 
 
414 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  34.84 
 
 
418 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  31.13 
 
 
415 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  32.85 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  32.84 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  33.17 
 
 
441 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  32.67 
 
 
415 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  32.84 
 
 
435 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  33.76 
 
 
434 aa  136  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  28.57 
 
 
421 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  31.79 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  31.52 
 
 
410 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  31.59 
 
 
414 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  30.58 
 
 
420 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  34.09 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  34.23 
 
 
405 aa  127  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  29.65 
 
 
414 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  30.67 
 
 
410 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  27.19 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  31.2 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  30.38 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  31.09 
 
 
414 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  29.9 
 
 
425 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  26 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  29.81 
 
 
444 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.84 
 
 
430 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.93 
 
 
434 aa  87.4  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  26.64 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.2 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  25.33 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  27.01 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  27.68 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.75 
 
 
431 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  27.36 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.51 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  25 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  28.49 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  28.11 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  25.23 
 
 
418 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.49 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.56 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.56 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.44 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.49 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.05 
 
 
391 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  39.69 
 
 
295 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.31 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  26.01 
 
 
449 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.99 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  26.89 
 
 
426 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  24.64 
 
 
430 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.84 
 
 
430 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.77 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  27.45 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.06 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  24.5 
 
 
460 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.97 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  22.9 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  29.64 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  26.45 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  26.61 
 
 
433 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  31.15 
 
 
152 aa  56.6  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  31.54 
 
 
434 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  31.54 
 
 
434 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  37 
 
 
434 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  29.19 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.38 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  37 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  26.52 
 
 
409 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>