19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0340 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  942    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  68.43 
 
 		 448 aa  633  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  63.44 
 
 		 449 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  60.79 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  57.89 
 
 		 457 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  46.44 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  35.48 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  32.31 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  30.59 
 
 		 430 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  30.65 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  30.65 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0258  hypothetical protein  35.14 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000478609  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  32.23 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  25.43 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  27.39 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  42.31 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  27.33 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  27.33 
 
 		 419 aa  43.5  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  23.65 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>