149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2093 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 412 aa  842    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  42.58 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  41.29 
 
 		 430 aa  275  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  40.33 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  37.17 
 
 		 435 aa  246  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  35.57 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  37.74 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  34.58 
 
 		 430 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  35.63 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  36.79 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  39.01 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  34.5 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  35.07 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  33.01 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.68 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  34.47 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  37.9 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  33.59 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  34.38 
 
 		 404 aa  199  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  34.79 
 
 		 429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.25 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  33.5 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  35.82 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  34.96 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  31.99 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  35.25 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  34.02 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  31.66 
 
 		 330 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  32.56 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  34.18 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  34.03 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  32.08 
 
 		 421 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  32.41 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  34.56 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  31.41 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  31.23 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  33.51 
 
 		 409 aa  149  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  33.84 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  35.8 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  32.38 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  30.77 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  30.68 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  31.97 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  32.32 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  32.06 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  32.78 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  31.08 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  32.78 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  32.49 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  30.65 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  30.69 
 
 		 444 aa  113  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.1 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.37 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  25.56 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.73 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  22.01 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  24.52 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.58 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  23.57 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  31.01 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  24.24 
 
 		 433 aa  86.3  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  25.46 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  23.1 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  26.14 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  25.81 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.87 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.21 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  24.89 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  26.46 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  24.47 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  24.05 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  24.47 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  23.6 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  23.63 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  27.31 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.76 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.76 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  25.73 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  23.46 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  31.56 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.13 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  33 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  23.75 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.94 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  25.28 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  27.34 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27.56 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  31.19 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  33.82 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  25.68 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25.39 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  27.68 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  28.63 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  27.31 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  28.43 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  26.85 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>