226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0403 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 430 aa  855    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  32.31 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  32.86 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  32.86 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  32.39 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  32.63 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  32.39 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  33.73 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  30.16 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  29.51 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 437 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  31.78 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  32.84 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  32.67 
 
 		 413 aa  156  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  33.68 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  32.56 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  32.94 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  35.86 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  34.47 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  33.63 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  28.67 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  30.91 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  33.99 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  29.38 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  27.48 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  31.1 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.37 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  26.53 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.25 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 		 434 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  28.79 
 
 		 312 aa  91.3  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25.11 
 
 		 438 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  26.16 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  29.77 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.07 
 
 		 430 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.16 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.91 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  37.95 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.89 
 
 		 419 aa  87.4  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.12 
 
 		 430 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  23.96 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  37.35 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  29.29 
 
 		 312 aa  86.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.87 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  34.36 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  30.34 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  27.6 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25.2 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.54 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.53 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.53 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.17 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  25.72 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.1 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.41 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  35 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.07 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  24.88 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.12 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  27.07 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  25.64 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  25.64 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  25.61 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  25.64 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  26.3 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  24.33 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  25.64 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  26.22 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  25.64 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  25.93 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  28.82 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  30.38 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.42 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  24.91 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  26.43 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  25.74 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  26.09 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  28.27 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  28.82 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  26.33 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  28.37 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  27 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  32.58 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  30.97 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  28.77 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  28.57 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  32.3 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  26.87 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  27.73 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  28.57 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  30.99 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.85 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  26.5 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  32.41 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  25.84 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  25.84 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  28.37 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  26.98 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>