138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2079 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  838    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  76.83 
 
 		 410 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  49.76 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  35.94 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  36.38 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  35.57 
 
 		 435 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  37.47 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  35.7 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  36.75 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  35.45 
 
 		 415 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  34.67 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  35.38 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.19 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  34.98 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  35.19 
 
 		 418 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  34.58 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  31.34 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  34.89 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  33.96 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  37.28 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  33.42 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  31.54 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  32.52 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  33.76 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  31.96 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  29.66 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  32.7 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  28.78 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  32.68 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  30.65 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.52 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  34.81 
 
 		 429 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  31.11 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  29.72 
 
 		 460 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  27.72 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  30.14 
 
 		 420 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  30.06 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  30.54 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  28.35 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  27.46 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  30.06 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  29.52 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  32.04 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  32.79 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  30.18 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  28.83 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  32.22 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  29.33 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  28.24 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  27.99 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  26.61 
 
 		 418 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.05 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  31.9 
 
 		 431 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  27.05 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  26.77 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  30.92 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  25.61 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  24.87 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.09 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  28.01 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  24.55 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.52 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  26.72 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.96 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.96 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.07 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  29.5 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  28.16 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.8 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.62 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  34.13 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.05 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27.71 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  25.67 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  23.8 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30.53 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.83 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  26.7 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  25.69 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  24.17 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  26.63 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.41 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  25.22 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  30.77 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  31.18 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  28.93 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  29.56 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  24.05 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  28.93 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  28.93 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  28.93 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  26.36 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  24.3 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.22 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  29.41 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  24.87 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  30.94 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  30.18 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  23.6 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>