156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5419 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  100 
 
 		 448 aa  922    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  49.3 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  48.06 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  48.49 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  36.52 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  33.42 
 
 		 437 aa  171  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  33.16 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  29.58 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  30.8 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  31.32 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  29.13 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  30.48 
 
 		 420 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  30.2 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  32.46 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  30.2 
 
 		 420 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  30.2 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  30.2 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  31.41 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  29.73 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  29.43 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  29.06 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30.91 
 
 		 430 aa  120  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  28.27 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  28.68 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  29.04 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  27.44 
 
 		 317 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  29.03 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.85 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  30.77 
 
 		 305 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  27.89 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.33 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  27.87 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  29.32 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.67 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.67 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  28.14 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  27.16 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  27.74 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  25.92 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  26.51 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  27.05 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  27.15 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  25.9 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  29.86 
 
 		 251 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  23.08 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  27.42 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  27.12 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  33.77 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  27.34 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  27.32 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  30.32 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  25.34 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  22.89 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.44 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  27.96 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.09 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  30.23 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.95 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.72 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  25.5 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  28.01 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  26.74 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  27.6 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  25.27 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  23.08 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.7 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  26.24 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.82 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  23.75 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  23.75 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  23.4 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  23.4 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  23.4 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  23.4 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  23.4 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  27.47 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  23.47 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  26.5 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  27.01 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  26.94 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  27.81 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.34 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.89 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  26.03 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.78 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  25.31 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  26.07 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  27.01 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  27.07 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  23.37 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  23.2 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  26.75 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  22.7 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  25.19 
 
 		 444 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.41 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25.28 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>