180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1825 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 		 415 aa  832    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  34.29 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  33.25 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  32.75 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  36.02 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  31.67 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  29.78 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  33.6 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  29.69 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  29.45 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  29.22 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  28.98 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  29.25 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  33.68 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  33.16 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  32.46 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  32.45 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  29.44 
 
 		 437 aa  126  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  31.02 
 
 		 453 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  28.95 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  29.29 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  31.54 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.55 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  30.68 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  36.89 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.21 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.62 
 
 		 454 aa  96.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  31.01 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  26.22 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  24.93 
 
 		 440 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  26.45 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  24.25 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  29.27 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  29.01 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  25.87 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  24.23 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  27.38 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  28.18 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  25.66 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  25.66 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  25.66 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  25.66 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  25.66 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.86 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  27.23 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  24.09 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.13 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  28.93 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  26.85 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.13 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.09 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.88 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.88 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  26.67 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  24.23 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  26.94 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  27.04 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  26.27 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  27.86 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  26.8 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  28.29 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  26.8 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  28.35 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  28.35 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  28.35 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  28.35 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  28.35 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  26.3 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  28.35 
 
 		 622 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.97 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  26.73 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  28.77 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  23.52 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  25.69 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.9 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.49 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  26.44 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.39 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  25.81 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  25.81 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  26.41 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  26.73 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  28.57 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  23.82 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  25.79 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  25.49 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  29.02 
 
 		 318 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  27.25 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.41 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  26.92 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  27.33 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  27.48 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.54 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  24.62 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  24.5 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  29.26 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  29 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>