138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5936 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 		 456 aa  932    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  45.98 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  44.44 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  44 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  43.17 
 
 		 453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  38.88 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  36.79 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  37.04 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  37.41 
 
 		 423 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  39.13 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  37.04 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  37.47 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  37.01 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  36.81 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  34.21 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  37.28 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.73 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  33.24 
 
 		 460 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  32.52 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  29.24 
 
 		 422 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  33.81 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  32.13 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  29.52 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  29.52 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  30.22 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  31.03 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  30.46 
 
 		 434 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  34.48 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  32.25 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  28.79 
 
 		 382 aa  117  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.97 
 
 		 418 aa  114  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  30.35 
 
 		 435 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  27.87 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  30.25 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  28.9 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  28.49 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  30.94 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  27.93 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  31.04 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  26.52 
 
 		 440 aa  100  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  28.82 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  30.67 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  28.9 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  30.68 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  26.42 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  27.53 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  28.37 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  28.37 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  26.82 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  28.37 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  28.37 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  28.37 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.79 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  27.14 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  28 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  28.78 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  29.57 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  27.56 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  28.79 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  29.06 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  29.06 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  31.47 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  28.37 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  28.37 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  28.37 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  28.37 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  28.37 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  26.53 
 
 		 425 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  28.37 
 
 		 622 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.84 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  25.14 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  29.55 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  27.58 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  29.55 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  24.68 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  28.91 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  27.71 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  27.07 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  27.1 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.14 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  26.59 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  25.59 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  26.1 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  27.68 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  27.99 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  25.95 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  28.29 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  24.21 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  25.59 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  27.06 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  26.69 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  27.21 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  24.78 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  29 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  29.13 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  26.38 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  28.36 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.72 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>