170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2121 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  98.01 
 
 		 440 aa  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  98.01 
 
 		 440 aa  710    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  100 
 
 		 351 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  98.01 
 
 		 440 aa  710    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  98.01 
 
 		 440 aa  710    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  98.01 
 
 		 440 aa  710    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  60 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  52.99 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  52.84 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  54.03 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  51.8 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  97.16 
 
 		 176 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  46.97 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  47.31 
 
 		 441 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  44.22 
 
 		 435 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  43.64 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  42.9 
 
 		 437 aa  262  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  41.3 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  41.96 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  40.57 
 
 		 442 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  41.96 
 
 		 444 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  39.37 
 
 		 444 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  41.98 
 
 		 433 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  41.95 
 
 		 440 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  41.67 
 
 		 444 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  41.57 
 
 		 440 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  42.65 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  39.29 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  40.94 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  38.77 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  42.69 
 
 		 445 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  41.67 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  39.94 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  40.94 
 
 		 446 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  41.21 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  41.74 
 
 		 435 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  41.67 
 
 		 440 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  41.52 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  41.52 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  41.54 
 
 		 446 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  38.86 
 
 		 622 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  38.86 
 
 		 450 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  38.86 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  38.86 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  38.86 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  38.86 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  41.12 
 
 		 447 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  40.11 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  40.96 
 
 		 445 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  39.26 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  39.83 
 
 		 449 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  38.44 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  38.38 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  38.98 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  36 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  30.45 
 
 		 433 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  35.06 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  30.84 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  32.82 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  29.83 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  29.83 
 
 		 433 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.69 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  30.43 
 
 		 433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  30.11 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  32.93 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  30.46 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.05 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.46 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25.3 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  31.07 
 
 		 411 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.76 
 
 		 450 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  29.73 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  30.51 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  30.51 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  32.68 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  27.58 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  32.71 
 
 		 416 aa  99.4  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  28.89 
 
 		 427 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  28.62 
 
 		 450 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  29.21 
 
 		 434 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  30.08 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.12 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.12 
 
 		 430 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  31.61 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  32.42 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  30.3 
 
 		 433 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  29.48 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  33.07 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  25.23 
 
 		 419 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  27.52 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  41 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.94 
 
 		 460 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30.83 
 
 		 451 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  30.68 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  30.73 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  32.55 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  27.07 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  28.19 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  26.72 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.52 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>