145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1506 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  66.59 
 
 
445 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  100 
 
 
449 aa  926    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  56.03 
 
 
447 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  54.93 
 
 
446 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  52.13 
 
 
446 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  52.9 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  49.55 
 
 
450 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  48.74 
 
 
450 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  48.97 
 
 
444 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  48.74 
 
 
450 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  48.74 
 
 
450 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  48.74 
 
 
450 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  48.85 
 
 
622 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  48.74 
 
 
450 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  47.06 
 
 
444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  45.5 
 
 
444 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  45.66 
 
 
446 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  45.43 
 
 
446 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  48.04 
 
 
444 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  45.43 
 
 
446 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  45.5 
 
 
444 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  44.97 
 
 
446 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  45.8 
 
 
442 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  46 
 
 
445 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  45.58 
 
 
440 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  44.39 
 
 
441 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  45.54 
 
 
439 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  44.8 
 
 
435 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  44.8 
 
 
435 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  44.72 
 
 
440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  44.16 
 
 
441 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  44.63 
 
 
440 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  46.32 
 
 
380 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  41.69 
 
 
435 aa  339  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  42.13 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  41.4 
 
 
438 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  43.82 
 
 
435 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  43.71 
 
 
433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  40.77 
 
 
439 aa  325  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  42.36 
 
 
435 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  40.13 
 
 
437 aa  309  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  38.94 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  38.78 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  40.27 
 
 
440 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  40.27 
 
 
440 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  40.27 
 
 
440 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  40.27 
 
 
440 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  40.27 
 
 
440 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  41.24 
 
 
443 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  39.59 
 
 
450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  39.83 
 
 
351 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  35.07 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  28.44 
 
 
435 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  32.78 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  29.89 
 
 
426 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.13 
 
 
422 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  34.12 
 
 
414 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  33.14 
 
 
480 aa  153  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  31.21 
 
 
427 aa  140  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  32.76 
 
 
411 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  29.53 
 
 
454 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  30.02 
 
 
435 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  33.04 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  29.57 
 
 
422 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  35.19 
 
 
176 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  49.54 
 
 
116 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  28.57 
 
 
427 aa  99.8  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  28.74 
 
 
416 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  30.27 
 
 
362 aa  96.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  29.01 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  40.52 
 
 
222 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  24.02 
 
 
433 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  25.59 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.79 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  26.49 
 
 
431 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  23.11 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  26.56 
 
 
450 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  24.6 
 
 
433 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.59 
 
 
433 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25 
 
 
423 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.68 
 
 
430 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.07 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.07 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  23.08 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.37 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  29.55 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  25.47 
 
 
450 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  28.44 
 
 
449 aa  83.2  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  28.7 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  26.55 
 
 
451 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  30.28 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  24.87 
 
 
433 aa  79  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  27.17 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  28.23 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  28.23 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  27.33 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>