157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1299 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  100 
 
 
395 aa  802    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  36.69 
 
 
425 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  36.32 
 
 
403 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  35.54 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  33.77 
 
 
402 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  28.01 
 
 
410 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  38.94 
 
 
251 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  27.63 
 
 
457 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  29.68 
 
 
439 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  28.12 
 
 
449 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  26.99 
 
 
449 aa  133  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  28.72 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  26.14 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  26.27 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.67 
 
 
408 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  26.27 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  26.42 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  30.74 
 
 
312 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 
420 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  24.27 
 
 
409 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  26.1 
 
 
430 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.65 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  30.71 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  30.2 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  23.71 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  29.95 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  26.26 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  26.01 
 
 
617 aa  79.7  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  24.12 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  29.47 
 
 
318 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  22.7 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  25.3 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  29.35 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  23.49 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  23.49 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  26.69 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  26.9 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  27.72 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  27.17 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  24.72 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  25.15 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  26.61 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  24.02 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  24.53 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  26.63 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  24.28 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  29.61 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  24.79 
 
 
613 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.54 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  24.75 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  23.73 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.41 
 
 
434 aa  67  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  25.59 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  28.26 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  27.84 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.37 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  29.93 
 
 
620 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  24.91 
 
 
418 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  25.53 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  27.78 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  24.13 
 
 
437 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  25.28 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  24.13 
 
 
437 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  26.64 
 
 
460 aa  63.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  24.17 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  24.17 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  26.15 
 
 
435 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.22 
 
 
425 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  23.86 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  24.17 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  24.17 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  22.97 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  24.17 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.68 
 
 
435 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  23.71 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  25.35 
 
 
453 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  26.21 
 
 
524 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  23.19 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  25.57 
 
 
415 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  26.43 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  25.23 
 
 
419 aa  59.7  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  26.85 
 
 
437 aa  59.7  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  23.62 
 
 
409 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  23.37 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.33 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  26.45 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  27.94 
 
 
433 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  22.9 
 
 
435 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  21.83 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  22.75 
 
 
440 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  29.02 
 
 
440 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  27.6 
 
 
440 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  27.41 
 
 
440 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  22.19 
 
 
454 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  22.48 
 
 
460 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  23.08 
 
 
446 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  35.71 
 
 
420 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  25.37 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  24.05 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>