135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1930 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  929    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  70.18 
 
 		 449 aa  651    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  64.37 
 
 		 444 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  34.32 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  32.73 
 
 		 403 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  32.57 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  29.93 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  29.41 
 
 		 381 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  28.12 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  30.45 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  30.71 
 
 		 251 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  29.94 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.55 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  26.87 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.73 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  26.42 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  24.6 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  25.87 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  27.98 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.37 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  27.87 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  25.07 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  26.59 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.68 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.15 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.85 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.74 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  26.55 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  25.64 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  28.53 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.54 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 617 aa  63.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25.8 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.87 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  24.21 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  28.25 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.95 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  27.56 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  22.83 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  32.54 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  31.78 
 
 		 620 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  26.1 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  26.63 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.53 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  27 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  30.37 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  28.29 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  28.29 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  23.35 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25.81 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  32.06 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  28.89 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.14 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.14 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  24.76 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  28.15 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  28.15 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  28.15 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  28.15 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.02 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  26.87 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  23.97 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  26.63 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  25.5 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  26.37 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.04 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  31.62 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  27.41 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  27.59 
 
 		 422 aa  54.3  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  24.31 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  25.44 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  22.76 
 
 		 454 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  24.25 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  30.43 
 
 		 527 aa  53.5  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  24.25 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  24.25 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  24.25 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  24.25 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  24.25 
 
 		 622 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  25 
 
 		 526 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  26.71 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  23.76 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  23.2 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  23.2 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  25.66 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  27.13 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  24.93 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  22.89 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.32 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  25.83 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20530  hypothetical protein  42.11 
 
 		 84 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  27.02 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  24.22 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  24.54 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>