64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0939 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  100 
 
 
527 aa  1079    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  35.4 
 
 
524 aa  276  5e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  31.12 
 
 
526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.36 
 
 
312 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  23.86 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  22.38 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  25.8 
 
 
414 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  25.82 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  24.05 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  25.82 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  25.19 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.82 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.82 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  25.93 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  33.33 
 
 
251 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  23.74 
 
 
416 aa  63.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  25.41 
 
 
432 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  22.22 
 
 
613 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  26.42 
 
 
305 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  32.5 
 
 
318 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25.35 
 
 
430 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  24.19 
 
 
402 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  25 
 
 
422 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  24.54 
 
 
400 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  21.56 
 
 
437 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  31.87 
 
 
318 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  24.23 
 
 
418 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  22.4 
 
 
617 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  23.85 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  22.83 
 
 
409 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.98 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  24.35 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  24.14 
 
 
413 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  31.84 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  30.63 
 
 
317 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  23.61 
 
 
450 aa  53.5  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  21.75 
 
 
435 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  24.07 
 
 
450 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  25.38 
 
 
418 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  30.43 
 
 
449 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  21.45 
 
 
380 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  24.66 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  27 
 
 
439 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  28.64 
 
 
318 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  24.14 
 
 
435 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  27.33 
 
 
410 aa  50.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.52 
 
 
418 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  24.76 
 
 
453 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  26.09 
 
 
444 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  25.66 
 
 
312 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  21.78 
 
 
435 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.96 
 
 
395 aa  49.3  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  25.35 
 
 
456 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  22.75 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  28.68 
 
 
433 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  25 
 
 
430 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  23.91 
 
 
480 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  20.71 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  22.29 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  21.38 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  29.2 
 
 
434 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  25.12 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  20.72 
 
 
418 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>