108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0242 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  100 
 
 		 526 aa  1067    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  31.12 
 
 		 527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  31.88 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25.27 
 
 		 430 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  24.73 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  30.29 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  22.04 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  22.04 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  20.18 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  31.87 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  21.75 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  27.84 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  26.52 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  33.09 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  33.09 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  33.09 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  33.09 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  33.09 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  26.39 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  20.32 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  33.09 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  24.27 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.48 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  27.04 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  25.83 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  21.1 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  22.03 
 
 		 418 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  26.63 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  28.42 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  31.25 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  21.21 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  30.6 
 
 		 435 aa  57  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  23.96 
 
 		 422 aa  57  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  26.54 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  22.87 
 
 		 613 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  24.63 
 
 		 440 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  25.12 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  28.31 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  22.49 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.15 
 
 		 404 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  27.57 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  26.92 
 
 		 622 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  29.29 
 
 		 453 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.74 
 
 		 408 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  26.83 
 
 		 396 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  26.92 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  25 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  22.42 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  26.92 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  26.92 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  26.92 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  26.92 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  28.28 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  27.1 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  22.31 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  28.08 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  26.32 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  26.64 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  27.1 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  26.64 
 
 		 420 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  26.97 
 
 		 251 aa  51.6  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  26.45 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  18.69 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  21.97 
 
 		 426 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  30.15 
 
 		 444 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  31.53 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  25.37 
 
 		 620 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  28.85 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  23.65 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  27.88 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  26.83 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  20.11 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  27.21 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  26.98 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  26.98 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  28.85 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  26.47 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  25.97 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  28.7 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  27.88 
 
 		 446 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  27.88 
 
 		 446 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  28.06 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  28.68 
 
 		 442 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  21.67 
 
 		 450 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  25.5 
 
 		 410 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  24.04 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  21.05 
 
 		 418 aa  47  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  29.06 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  23.26 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  22.22 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  23.55 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  22.04 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  22.6 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  29.63 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  23.38 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  25.81 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>