125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4200 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  50.24 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  49.64 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  37.04 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  36.3 
 
 		 434 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  39.06 
 
 		 441 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  35.57 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  37.06 
 
 		 418 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  40.12 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  34.79 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  33.41 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  33.42 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  35.52 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  34.16 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  35.15 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  33.42 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  33.92 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  32.08 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  32.7 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  35.16 
 
 		 407 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  29.4 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  33.6 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  39.71 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  34.2 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  32.49 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  31.14 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  32.78 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  34.45 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  32.22 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  35.08 
 
 		 420 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  34.71 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  31.59 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  31.71 
 
 		 420 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  31.42 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  30.73 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  30.53 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  31.73 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  32.69 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  28.01 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  30.47 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  32.74 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  30.89 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  28.91 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  28.07 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29.57 
 
 		 407 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  28.87 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  31.51 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  28.4 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  25.74 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  27.57 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  29.27 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  27.84 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  27.48 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.78 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  28.62 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  26.33 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  25 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  28.43 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.45 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.86 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  28.48 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  28.94 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.81 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  25.32 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  27.86 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  24.19 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  24.66 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.34 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  26.85 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  26.79 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  26.05 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25.44 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  26.43 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  26.43 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  26.67 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  26.43 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  25 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  32.28 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  33.53 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.08 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  31.45 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.51 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  28.67 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  30.82 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  30.82 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  24.05 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.3 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.54 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  25.96 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  29.37 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  31.58 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  25.45 
 
 		 416 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  31.18 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.16 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  28.42 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.16 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>