115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3781 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  899    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  54.61 
 
 
433 aa  480  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  53.57 
 
 
434 aa  474  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  51.4 
 
 
435 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  50.23 
 
 
435 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  48.5 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  47.39 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  45.97 
 
 
433 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  45.86 
 
 
430 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  47.1 
 
 
429 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  43.06 
 
 
439 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  46.88 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  41.73 
 
 
426 aa  325  7e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  31.25 
 
 
418 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  32.19 
 
 
380 aa  169  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.28 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  29.88 
 
 
419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  29.63 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  28.99 
 
 
419 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  28.99 
 
 
419 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  28.38 
 
 
449 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.43 
 
 
431 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  29.25 
 
 
424 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  30.2 
 
 
418 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  29.17 
 
 
419 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  30.63 
 
 
391 aa  143  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  27.03 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  27.82 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  31.4 
 
 
295 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  27.82 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  25.49 
 
 
407 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  26.12 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  25.68 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  27.43 
 
 
420 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  28.21 
 
 
409 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  26.81 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  27.65 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  23.99 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  27.32 
 
 
421 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  26.69 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  21.84 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.83 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  23.1 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  26.71 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  24.53 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  24.46 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  26.3 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  25.75 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  24 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  24.24 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  25 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  21.75 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  24.51 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.76 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  24.31 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  26.01 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  21.12 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  23.17 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  24.65 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  23.4 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  25.76 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  25.95 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  23.73 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  25.16 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  32.91 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  22.99 
 
 
440 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  34.26 
 
 
120 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  23.42 
 
 
435 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  24.34 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  26.6 
 
 
318 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  22.53 
 
 
440 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  25.28 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  22.52 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  25.76 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  24.34 
 
 
431 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  28.64 
 
 
317 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  23.87 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  24.5 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  22.75 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  27.81 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  29.37 
 
 
312 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  27.81 
 
 
318 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  29.33 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  25 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  29.87 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.63 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  28.49 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  26.32 
 
 
152 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  25.95 
 
 
412 aa  53.5  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  23.7 
 
 
312 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  26.32 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  24.46 
 
 
410 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  23.51 
 
 
425 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  23.08 
 
 
435 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  24.02 
 
 
430 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  27.03 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  26.97 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  29.63 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>