150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0628 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  100 
 
 
392 aa  816    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  70.48 
 
 
439 aa  607  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  55.47 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  47.19 
 
 
435 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  46.17 
 
 
435 aa  361  9e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  46.88 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  46.06 
 
 
433 aa  347  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  43.54 
 
 
433 aa  347  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  45.23 
 
 
434 aa  345  8.999999999999999e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  42.42 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  40.36 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  41.77 
 
 
430 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  38.61 
 
 
426 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  30.34 
 
 
419 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  29.75 
 
 
419 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  32.58 
 
 
380 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  31.45 
 
 
418 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  29.67 
 
 
449 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  29.32 
 
 
419 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  29.32 
 
 
419 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  27.47 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  28.61 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.01 
 
 
431 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  29.17 
 
 
444 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  32.31 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  28.88 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  29.6 
 
 
411 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  29.74 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  27.39 
 
 
414 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  29.69 
 
 
295 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  27.71 
 
 
407 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  26.09 
 
 
412 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  28.67 
 
 
404 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  25.54 
 
 
430 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.19 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  26.71 
 
 
431 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  23.12 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  25.15 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  24.81 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  23.1 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.57 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  28.08 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  25.2 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  25.41 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  26.95 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  25.41 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  25.64 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  23.94 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  25.39 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  24.05 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  22.74 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  22.8 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  25.71 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  22.95 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  26.76 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  28.16 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  28.8 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  31.75 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  23.29 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  22.25 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  24.27 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  23.53 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  24.46 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  22.79 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  24.69 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  30.41 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  22.77 
 
 
407 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  28.57 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  29.05 
 
 
152 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  27.11 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  23.84 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  26.05 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  28.9 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  28.9 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  24.08 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.59 
 
 
434 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.59 
 
 
434 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  25.51 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  24.34 
 
 
414 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  28.22 
 
 
317 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  28.76 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  23.65 
 
 
425 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  32.03 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  24.58 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.46 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  25.26 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  25.4 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  25.4 
 
 
434 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  24.42 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  25.54 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  24.66 
 
 
527 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  42.59 
 
 
120 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  24.49 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  23.89 
 
 
416 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  26.47 
 
 
433 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  29.45 
 
 
409 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.77 
 
 
430 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>