133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2264 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  100 
 
 
435 aa  902    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  94.02 
 
 
435 aa  851    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  54.21 
 
 
433 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  51.4 
 
 
430 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  48.94 
 
 
433 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  48.39 
 
 
433 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  47.7 
 
 
434 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  46.54 
 
 
432 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  48.47 
 
 
430 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  44.34 
 
 
439 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  46.3 
 
 
429 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  47.19 
 
 
392 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  45.28 
 
 
426 aa  361  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  28.77 
 
 
418 aa  172  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  33.14 
 
 
380 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  33.06 
 
 
419 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  33.06 
 
 
419 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  30.64 
 
 
431 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  31.11 
 
 
419 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  32.01 
 
 
444 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  30.37 
 
 
419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  32.64 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  30.9 
 
 
429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  31.11 
 
 
419 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  28.64 
 
 
424 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  28.38 
 
 
449 aa  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  30.5 
 
 
418 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  30 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.83 
 
 
295 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  25 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.19 
 
 
407 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  27.09 
 
 
412 aa  96.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  28.27 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  27.61 
 
 
421 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  24.76 
 
 
430 aa  94  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  29.68 
 
 
404 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  25.63 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  26.48 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  26.64 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  27.13 
 
 
409 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  26.64 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  25.36 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  26.32 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  26.33 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  24.88 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  24.76 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  30.91 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  25.06 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  26.26 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.27 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  25.44 
 
 
441 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  25.96 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  28.88 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  26.43 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  27.95 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.09 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  24.4 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  23.08 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  24.8 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  25.14 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  38.1 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  23.26 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  25.47 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  23.29 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  25.14 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  25.92 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  26.01 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  24.69 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  26.01 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  23.75 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  25.11 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  26.63 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  23.75 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  28.14 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  25.42 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  27.87 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  38.83 
 
 
152 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  27.2 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  23.93 
 
 
330 aa  63.2  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  23.8 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  24.93 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  26.18 
 
 
317 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  26.18 
 
 
430 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  25.58 
 
 
429 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  22.22 
 
 
312 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  28.4 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  29.93 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  30 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28 
 
 
430 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  21.75 
 
 
527 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  24.21 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  26.2 
 
 
251 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  20.42 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  25.89 
 
 
403 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  25.95 
 
 
450 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 
420 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 
420 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>