111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0465 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  100 
 
 
419 aa  830    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  37.9 
 
 
444 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  37.09 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  36.27 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  36.27 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  34.54 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  35.79 
 
 
419 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  36.12 
 
 
419 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  33.63 
 
 
418 aa  192  7e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  36.18 
 
 
431 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  37.18 
 
 
391 aa  186  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  29.95 
 
 
433 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  43.26 
 
 
295 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  32.99 
 
 
426 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  31.76 
 
 
429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  29.66 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  31.37 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  31.56 
 
 
424 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  30.32 
 
 
435 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  32.36 
 
 
449 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  31.83 
 
 
418 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  30.48 
 
 
392 aa  156  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  31.62 
 
 
430 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  28.88 
 
 
434 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  29.28 
 
 
433 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  28.65 
 
 
433 aa  153  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  30.96 
 
 
432 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  30.17 
 
 
411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  27.61 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  31.83 
 
 
409 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  30.17 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  29.04 
 
 
421 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  29.1 
 
 
412 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  28.86 
 
 
407 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  28.45 
 
 
423 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  31.32 
 
 
414 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  30.66 
 
 
412 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  30.11 
 
 
404 aa  100  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  31.4 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  31.73 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  30.48 
 
 
435 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  31.49 
 
 
435 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  31.27 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  30.77 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  31.02 
 
 
420 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  32.01 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  32.17 
 
 
430 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  26.93 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  31.58 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  29.46 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  29.43 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  33.72 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  32.27 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  28.18 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  31.91 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  25.89 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  28.43 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  31.14 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  30.12 
 
 
431 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  25.87 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  27.8 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  29.66 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  28.81 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  30.14 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  29.97 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  27.16 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  27.76 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  28.84 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  27.07 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  39.32 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  26.18 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  33.94 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  27.35 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  26.07 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  27.56 
 
 
430 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  25.91 
 
 
317 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  27.48 
 
 
318 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  26.97 
 
 
318 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  27.97 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.27 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  28.66 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  31.67 
 
 
305 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  25.13 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  21.88 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  28.16 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  29.47 
 
 
431 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.03 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  29.7 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  30.52 
 
 
437 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.03 
 
 
434 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.03 
 
 
434 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  29.58 
 
 
427 aa  49.7  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.48 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  28.95 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.49 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  24.82 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  26.15 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>