164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2399 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  799    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  71.5 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  70.47 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  63.29 
 
 		 419 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  61.23 
 
 		 440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  60.43 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  57.6 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  47.2 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  44.95 
 
 		 411 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  35.07 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  35.93 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  31.71 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  34.6 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  33.59 
 
 		 430 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  32.45 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  30.73 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  32.58 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  38.35 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  31.42 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  33.86 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  31.88 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  36.33 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  35.29 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.64 
 
 		 414 aa  136  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  32.42 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  30.22 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  27.08 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  31.23 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  31.66 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  30.83 
 
 		 425 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  30.38 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  31.23 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  32.93 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  31.34 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.95 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  30.06 
 
 		 431 aa  123  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  32.43 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  30.86 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  29.43 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  30.09 
 
 		 429 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  30.08 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.49 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  31.89 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  31.71 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  33.09 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  30.95 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  32.12 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.83 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  26.37 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.19 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.8 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.52 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  27.97 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25.27 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.51 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  25.33 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  25.36 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  24.87 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  25.76 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  26.02 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.54 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  24.93 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.18 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.74 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  28.11 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  28.11 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  34.65 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  23.92 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  28.62 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  34.65 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.97 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  25.56 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  29.71 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  29.71 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  24.86 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  34.11 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  26.75 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  26.92 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  28.93 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  26.34 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  30.71 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  28.5 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  27.4 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  21.55 
 
 		 447 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.61 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  26.58 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  32.31 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  24.21 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  32.19 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  31.65 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  29.36 
 
 		 152 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  25.77 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  33.09 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  26.18 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>