166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1246 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  785    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  61.98 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  61.88 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  60.31 
 
 		 440 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  59.42 
 
 		 430 aa  454  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  59.11 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  57.6 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  52.77 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  45.29 
 
 		 411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  37.9 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  37.36 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  36.88 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  38.3 
 
 		 460 aa  192  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  34.55 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  35.58 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.11 
 
 		 412 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  32.54 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  34.77 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  35.43 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  35.42 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  35.77 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  34.03 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  30.4 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  32.41 
 
 		 414 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  32.69 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  35.03 
 
 		 417 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  37.05 
 
 		 420 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  36.13 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  35.16 
 
 		 409 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  32.15 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  30.45 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  31.69 
 
 		 421 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  31.52 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  36.95 
 
 		 418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  30.71 
 
 		 410 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  34.62 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  35.51 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  32.51 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  32.66 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  34.93 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  32.7 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  32.51 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  33.64 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  30.42 
 
 		 425 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  28.8 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  29.75 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  30.62 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.46 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  30.27 
 
 		 405 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  28.33 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  27.68 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  27.91 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.18 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  28.83 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  23.12 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25.06 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.77 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  23.84 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  26.35 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.57 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.37 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.28 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  30.06 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  23.4 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  27.45 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  29.28 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.25 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  25.36 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  27.72 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  26.86 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  33.52 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  26.52 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  26.52 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  28.25 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  31.07 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  27.33 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  28.11 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.38 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  29.19 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  28.11 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.88 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.18 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.43 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.53 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  25.55 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  25.55 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  32.8 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  28.22 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  25.84 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  24.25 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.33 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.28 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.8 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.02 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  23.46 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  25.57 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>