130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0949 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  100 
 
 
414 aa  822    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  40.93 
 
 
415 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  39.07 
 
 
414 aa  256  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  39.8 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  40.34 
 
 
415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  41.69 
 
 
418 aa  252  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  40.1 
 
 
415 aa  249  9e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  42.75 
 
 
415 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  42.69 
 
 
425 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  37.31 
 
 
421 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  40.88 
 
 
414 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  34.41 
 
 
434 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  36.32 
 
 
405 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  39.26 
 
 
423 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  35.23 
 
 
441 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  33.42 
 
 
433 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  34.95 
 
 
414 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  36.6 
 
 
410 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  34.58 
 
 
410 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  35.52 
 
 
414 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  32.89 
 
 
390 aa  169  9e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  33.33 
 
 
435 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  33.42 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  35.8 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  34.49 
 
 
430 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  34.49 
 
 
460 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  33.52 
 
 
409 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  31.93 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  28.5 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  30.41 
 
 
407 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  34.09 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  34.73 
 
 
430 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  33.75 
 
 
420 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  33.55 
 
 
440 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  32.08 
 
 
440 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  31.72 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  30.35 
 
 
419 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  34.62 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  31.89 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  28.38 
 
 
411 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  27.82 
 
 
431 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  30.5 
 
 
407 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  28.86 
 
 
417 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.89 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  25.38 
 
 
330 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  29.82 
 
 
431 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  30.14 
 
 
444 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  32.46 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  27.2 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 
433 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  27.2 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.94 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  28.45 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  27.48 
 
 
449 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  30.53 
 
 
405 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  27.25 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  28.07 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  26.15 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  28.66 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  27.37 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.2 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  30.41 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  25.89 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  25.91 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  28.81 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  25.14 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  25.93 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  24.66 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  26.01 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  25.22 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  25.22 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.09 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  28.68 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.65 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  27.5 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  31.65 
 
 
152 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  23.71 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  35.96 
 
 
295 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  30.27 
 
 
443 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  27.05 
 
 
402 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.29 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  30.38 
 
 
460 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.93 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  26.87 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  33.13 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  24.34 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  33.81 
 
 
430 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  28.44 
 
 
457 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  31.19 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  27.51 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  24.86 
 
 
318 aa  53.5  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  24.46 
 
 
434 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  24.46 
 
 
434 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  25.25 
 
 
318 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 
420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  26.7 
 
 
425 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  26.63 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  25.28 
 
 
312 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  27.86 
 
 
437 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>