149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2229 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  61.89 
 
 
435 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  57.54 
 
 
434 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  54.52 
 
 
441 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  34.79 
 
 
410 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  38.64 
 
 
415 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  39.13 
 
 
415 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  36.57 
 
 
415 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  36.63 
 
 
414 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  37.41 
 
 
415 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  37.04 
 
 
414 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  34.36 
 
 
410 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  35.17 
 
 
421 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  37.35 
 
 
415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  36.68 
 
 
423 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  35.08 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  35.06 
 
 
414 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  34.43 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  33.42 
 
 
414 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  34.12 
 
 
414 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  32.84 
 
 
390 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  34.45 
 
 
412 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  30.61 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  32.3 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  31.97 
 
 
412 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  30.34 
 
 
420 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  32.08 
 
 
419 aa  130  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  31.13 
 
 
435 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  35.01 
 
 
420 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  29.01 
 
 
435 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  30.93 
 
 
409 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  30.39 
 
 
430 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  29.54 
 
 
407 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  34.27 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  30.95 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  25.79 
 
 
330 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  31.62 
 
 
430 aa  114  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  31.21 
 
 
420 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  25.29 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  29.15 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  34.53 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  29.23 
 
 
431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  27.49 
 
 
408 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  30.41 
 
 
440 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  30.81 
 
 
405 aa  106  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  27.81 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.84 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  27.36 
 
 
431 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  29.52 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  27.46 
 
 
407 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  28.3 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  26.77 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  28.02 
 
 
435 aa  86.7  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  25.45 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  33.72 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  32.08 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  35.56 
 
 
152 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  28.61 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  25.06 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  25.46 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  36 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  26.45 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.65 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.85 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.4 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.8 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.67 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  25.06 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  36.03 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  32.76 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  27.53 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  25.28 
 
 
449 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  24.05 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.28 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.07 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  25.66 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  26 
 
 
411 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  24.84 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  27.27 
 
 
443 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  32.28 
 
 
312 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  22.48 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  27.81 
 
 
305 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  29.03 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  25.34 
 
 
439 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  24.37 
 
 
454 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  23.17 
 
 
419 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  23.17 
 
 
419 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 
392 aa  56.6  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  22.32 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  29.33 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  30.77 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  25.48 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.86 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  27.66 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  22.76 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  30.26 
 
 
318 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  29.29 
 
 
447 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  32.33 
 
 
408 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4226  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.45 
 
 
430 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>