24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4226 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4226  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  86.89 
 
 
415 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  92.16 
 
 
415 aa  98.2  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  76.67 
 
 
415 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  82.35 
 
 
414 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  76.47 
 
 
415 aa  87.8  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  78.43 
 
 
415 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0475  hypothetical protein  92.31 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  49.23 
 
 
414 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  57.89 
 
 
423 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  59.62 
 
 
418 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  55.77 
 
 
421 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  40.96 
 
 
441 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  39.58 
 
 
434 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  35.79 
 
 
414 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  48.53 
 
 
435 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  40 
 
 
433 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  43.14 
 
 
425 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  51.16 
 
 
414 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  54.55 
 
 
419 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  49.02 
 
 
430 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  47.46 
 
 
405 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  46.15 
 
 
430 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  46.3 
 
 
460 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>