152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3690 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  100 
 
 
414 aa  846    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  62.62 
 
 
414 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  41.88 
 
 
421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  40.82 
 
 
423 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  38.69 
 
 
415 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  39.95 
 
 
415 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  40.37 
 
 
414 aa  239  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  39.78 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  38.08 
 
 
418 aa  233  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  39.41 
 
 
415 aa  225  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  36.17 
 
 
415 aa  216  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  61.7 
 
 
152 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  34.43 
 
 
425 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  34.95 
 
 
414 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  36.03 
 
 
435 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  34.12 
 
 
433 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  33.91 
 
 
434 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  32.38 
 
 
410 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.27 
 
 
412 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  30.66 
 
 
390 aa  169  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.5 
 
 
410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  30.6 
 
 
460 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  35.2 
 
 
407 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  34.43 
 
 
405 aa  159  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  32.78 
 
 
412 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  31.53 
 
 
404 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  32.55 
 
 
409 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  33.17 
 
 
430 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  32.05 
 
 
441 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  33.5 
 
 
420 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  29.31 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  30.96 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  31.09 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  31.03 
 
 
420 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  31.03 
 
 
419 aa  122  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  27.64 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  29.8 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  30.62 
 
 
387 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.17 
 
 
419 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  27.45 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  30.08 
 
 
417 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  30.5 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  29.5 
 
 
430 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  27.96 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  30.88 
 
 
430 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.37 
 
 
431 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  29.31 
 
 
440 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  30.65 
 
 
431 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  29.77 
 
 
380 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  34.12 
 
 
420 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  28.45 
 
 
419 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  28.45 
 
 
419 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  28.46 
 
 
440 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  33.81 
 
 
391 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  27.97 
 
 
387 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.7 
 
 
419 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  27.7 
 
 
419 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  26.22 
 
 
429 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.81 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  29.6 
 
 
405 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  31.58 
 
 
295 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  26.39 
 
 
439 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  28.14 
 
 
435 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  25.95 
 
 
430 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  27.42 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  25.45 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  25.2 
 
 
430 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.51 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  25.13 
 
 
429 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  27.47 
 
 
435 aa  86.7  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  24.69 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29.91 
 
 
407 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.07 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  25.58 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  25.86 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  25.19 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.42 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  31.19 
 
 
251 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.24 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.82 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.74 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.03 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.87 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.74 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  29.04 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  30.86 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  30.57 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  25 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  24.78 
 
 
439 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  23.94 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.2 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  27.05 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.57 
 
 
312 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.57 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  26.95 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  28.41 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30.2 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  24.78 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>