40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0664 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  915    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  45.74 
 
 		 443 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1570  hypothetical protein  39.29 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2168  hypothetical protein  40.32 
 
 		 430 aa  259  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  38.29 
 
 		 462 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4986  hypothetical protein  44.94 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4855  hypothetical protein  39.21 
 
 		 452 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.874241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  36.59 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3571  hypothetical protein  38.02 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  29.89 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  26.73 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.71 
 
 		 409 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  28.43 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  28.26 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  29 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  26.13 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  28.41 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  27.33 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.48 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  27.09 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  23.73 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  25.68 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  25 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  28.98 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  24.58 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.62 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  26.54 
 
 		 418 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.05 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  28.88 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  28.41 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  22.29 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  24.02 
 
 		 312 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  27.81 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  24.29 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  28.42 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  20.43 
 
 		 312 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  25.7 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  26.75 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  29.29 
 
 		 433 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>