16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1570 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1570  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  918    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4855  hypothetical protein  85.75 
 
 		 452 aa  751    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.874241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2168  hypothetical protein  68.02 
 
 		 430 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  39.29 
 
 		 447 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  37.33 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3571  hypothetical protein  40.09 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  38.05 
 
 		 462 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  36.47 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4986  hypothetical protein  36.48 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.48 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  31.25 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  30.64 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.06 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  30.11 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  31.35 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  28.63 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>