31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4194 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  53.92 
 
 		 444 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  48.84 
 
 		 380 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  35.14 
 
 		 433 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  40 
 
 		 432 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  37.14 
 
 		 435 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  36.21 
 
 		 411 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  39.32 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  38.83 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  38.1 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  43.14 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  32.14 
 
 		 439 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  36.36 
 
 		 434 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  44.74 
 
 		 419 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  34.26 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  43.42 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  43.42 
 
 		 419 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  43.42 
 
 		 419 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  34.95 
 
 		 433 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  35.51 
 
 		 430 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  35.24 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  54.72 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  54.72 
 
 		 449 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  35.04 
 
 		 429 aa  62  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  33.33 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  38.37 
 
 		 418 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  52.94 
 
 		 431 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  31.07 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  42.59 
 
 		 392 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  34.43 
 
 		 415 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  29.27 
 
 		 410 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>