99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0568 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  241  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  63.06 
 
 		 435 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  53.57 
 
 		 439 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  53.7 
 
 		 222 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  54.95 
 
 		 439 aa  123  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  53.4 
 
 		 434 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  52.38 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  53.77 
 
 		 440 aa  114  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  53.77 
 
 		 440 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  53.77 
 
 		 440 aa  114  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  53.77 
 
 		 440 aa  114  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  53.77 
 
 		 440 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  48.25 
 
 		 439 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  48.25 
 
 		 435 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  47.37 
 
 		 438 aa  110  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  52.34 
 
 		 447 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  46.55 
 
 		 444 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  51 
 
 		 441 aa  103  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  49.54 
 
 		 449 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  47.86 
 
 		 446 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  47.86 
 
 		 446 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  47.32 
 
 		 450 aa  100  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  47.32 
 
 		 450 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  47.32 
 
 		 450 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  47.32 
 
 		 450 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  47.86 
 
 		 446 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  47.32 
 
 		 450 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  47.32 
 
 		 622 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  47.01 
 
 		 446 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  46.15 
 
 		 444 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  46.15 
 
 		 444 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  48.65 
 
 		 446 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  45.69 
 
 		 442 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  46.55 
 
 		 444 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  44.04 
 
 		 433 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  46.96 
 
 		 446 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  47.66 
 
 		 440 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  47 
 
 		 437 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  44.04 
 
 		 440 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  44.83 
 
 		 444 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  46.6 
 
 		 435 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  47 
 
 		 445 aa  90.5  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  46.79 
 
 		 435 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  46.79 
 
 		 435 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  42.48 
 
 		 450 aa  89.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  50.47 
 
 		 440 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  44.86 
 
 		 440 aa  87  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  43.36 
 
 		 446 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  41.51 
 
 		 445 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  40.37 
 
 		 443 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  43.69 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  36.27 
 
 		 426 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  37.14 
 
 		 461 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  60.71 
 
 		 380 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  37.25 
 
 		 480 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.69 
 
 		 425 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  37.5 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  34.91 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  33.72 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  34.74 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  35.64 
 
 		 449 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  33.33 
 
 		 404 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  33.33 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  33.03 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  32.5 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  33.04 
 
 		 434 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  33.04 
 
 		 434 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  31.37 
 
 		 427 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.77 
 
 		 454 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2167  HipA N-terminal domain protein  25.71 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0107029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  33.04 
 
 		 434 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  33.72 
 
 		 435 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  33.04 
 
 		 434 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  31.13 
 
 		 411 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0248  hypothetical protein  28.75 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0211  HipA N-terminal domain protein  25.71 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  34.23 
 
 		 418 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  33.96 
 
 		 430 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.3 
 
 		 382 aa  48.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  31.9 
 
 		 413 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  28.16 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  29.91 
 
 		 450 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0402  hypothetical protein  35.35 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  34.31 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  31.58 
 
 		 413 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  31.78 
 
 		 460 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  28.18 
 
 		 450 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30.63 
 
 		 430 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  26.73 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  34.31 
 
 		 433 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0379  HipA-like protein  40.74 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0366  HipA-like protein  40.74 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.43 
 
 		 414 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  30.71 
 
 		 443 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  30 
 
 		 413 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  34.04 
 
 		 435 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>