53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2167 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2167  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 		 107 aa  226  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0107029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0248  hypothetical protein  83.18 
 
 		 107 aa  197  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0211  HipA N-terminal domain protein  81.31 
 
 		 107 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  53.85 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  56.31 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  52.94 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  38.1 
 
 		 408 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0402  hypothetical protein  33.65 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  34.38 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  37.66 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  34.38 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  34.38 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  34.38 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  34.38 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  34.69 
 
 		 449 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  34.26 
 
 		 435 aa  52  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  33 
 
 		 426 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  25.71 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.53 
 
 		 382 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.99 
 
 		 414 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  31.68 
 
 		 440 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30 
 
 		 422 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  36.56 
 
 		 437 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  31.96 
 
 		 433 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  29.79 
 
 		 438 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  34.78 
 
 		 434 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  29.79 
 
 		 435 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  27.18 
 
 		 434 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  34.78 
 
 		 434 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  25 
 
 		 441 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  28.72 
 
 		 439 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  32 
 
 		 435 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  31.18 
 
 		 425 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  34.21 
 
 		 404 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  31.33 
 
 		 440 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  33.71 
 
 		 440 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  33.7 
 
 		 434 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  32.05 
 
 		 453 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  33.7 
 
 		 434 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.49 
 
 		 450 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  32.5 
 
 		 445 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  37.1 
 
 		 435 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 		 435 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 		 435 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  27.08 
 
 		 222 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  26.32 
 
 		 441 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  41.07 
 
 		 403 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  33.71 
 
 		 524 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  30.12 
 
 		 450 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  27.59 
 
 		 439 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  29.81 
 
 		 449 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  26.8 
 
 		 450 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>