73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0152 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 		 109 aa  224  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  57.01 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2167  HipA N-terminal domain protein  56.31 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0107029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  56.86 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0211  HipA N-terminal domain protein  53.4 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0248  hypothetical protein  52.43 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0402  hypothetical protein  43.21 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  40.2 
 
 		 408 aa  67  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  39.24 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  37.78 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  36 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  33.71 
 
 		 440 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  33.71 
 
 		 440 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  33.71 
 
 		 440 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  33.71 
 
 		 440 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 382 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  33.71 
 
 		 440 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  34 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  31.31 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  31.31 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  32.94 
 
 		 441 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  32 
 
 		 438 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  55.81 
 
 		 419 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  32.69 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.77 
 
 		 450 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  31.46 
 
 		 440 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  29.91 
 
 		 426 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  32.5 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  31.43 
 
 		 435 aa  52.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  32.53 
 
 		 435 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  26.53 
 
 		 441 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  31.4 
 
 		 437 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  29.07 
 
 		 439 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  29.63 
 
 		 422 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  29.21 
 
 		 453 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 		 402 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  30 
 
 		 433 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  31.73 
 
 		 409 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  35.29 
 
 		 443 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  32.69 
 
 		 418 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.63 
 
 		 414 aa  47.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  30.86 
 
 		 450 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  30.86 
 
 		 450 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  33.72 
 
 		 440 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  36.84 
 
 		 403 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  28.4 
 
 		 435 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  28.4 
 
 		 435 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  26.67 
 
 		 450 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  34.94 
 
 		 449 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  34.52 
 
 		 449 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  28.09 
 
 		 622 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  31.73 
 
 		 524 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  28.09 
 
 		 450 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  28.09 
 
 		 450 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  28.09 
 
 		 450 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  28.09 
 
 		 450 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  28.09 
 
 		 450 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  33.67 
 
 		 434 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  33.67 
 
 		 434 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  31.13 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.07 
 
 		 430 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  31.46 
 
 		 435 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  29.36 
 
 		 430 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  30.61 
 
 		 434 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  30.95 
 
 		 440 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  37.31 
 
 		 444 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  28.09 
 
 		 444 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  31.43 
 
 		 435 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  30.61 
 
 		 434 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  26.44 
 
 		 446 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  26.44 
 
 		 446 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  26.92 
 
 		 526 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  25.29 
 
 		 444 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>