63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0402 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0402  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  41.3 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  37.63 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  43.21 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0248  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  42.11 
 
 
435 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0211  HipA N-terminal domain protein  40 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2167  HipA N-terminal domain protein  33.65 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0107029  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  37.23 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  38.3 
 
 
408 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  38.24 
 
 
441 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  39.58 
 
 
396 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  36.73 
 
 
435 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  39.81 
 
 
409 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  37.5 
 
 
441 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  36.63 
 
 
426 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  38.24 
 
 
444 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  30.51 
 
 
453 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  34.31 
 
 
440 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  36.27 
 
 
439 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  35.42 
 
 
422 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  37.36 
 
 
449 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  35.35 
 
 
116 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  34 
 
 
440 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  31.53 
 
 
437 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  34 
 
 
440 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  34 
 
 
440 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  34 
 
 
440 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  34 
 
 
440 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  31.53 
 
 
437 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  33.66 
 
 
433 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  31.91 
 
 
437 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  39.24 
 
 
419 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  29.06 
 
 
443 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  30.19 
 
 
400 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  34.69 
 
 
437 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  35.05 
 
 
430 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  32.08 
 
 
404 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  35.51 
 
 
442 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  36.27 
 
 
450 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  36.27 
 
 
450 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  36.27 
 
 
450 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  36.27 
 
 
450 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  36.27 
 
 
450 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  35.71 
 
 
449 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  38 
 
 
440 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  36.27 
 
 
622 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  38.24 
 
 
435 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  39.6 
 
 
435 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  39.6 
 
 
435 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  31.96 
 
 
434 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  31.96 
 
 
434 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  30.63 
 
 
433 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  33.33 
 
 
450 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  36.11 
 
 
444 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.98 
 
 
425 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  34.69 
 
 
445 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  37.36 
 
 
414 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  35.29 
 
 
447 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  30.93 
 
 
434 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  30.93 
 
 
434 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  36.11 
 
 
444 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  36.11 
 
 
444 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>