23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0379 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0366  HipA-like protein  100 
 
 		 59 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0379  HipA-like protein  100 
 
 		 59 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  90.74 
 
 		 435 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  79.63 
 
 		 439 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  77.78 
 
 		 438 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  64.81 
 
 		 439 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  57.41 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  52.08 
 
 		 440 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  44.23 
 
 		 441 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  43.14 
 
 		 441 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  46.94 
 
 		 440 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  46.94 
 
 		 440 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  46.94 
 
 		 440 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  46.94 
 
 		 440 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  46.94 
 
 		 440 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  40.74 
 
 		 434 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  42.86 
 
 		 440 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  43.64 
 
 		 440 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  36.21 
 
 		 422 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  39.62 
 
 		 439 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  46.67 
 
 		 435 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  46.67 
 
 		 435 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>