49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2508 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2508  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  907    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.020002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2776  HipA domain protein  82.62 
 
 		 436 aa  732    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2372  HipA domain protein  82.62 
 
 		 436 aa  718    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27.33 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  24.67 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 		 440 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  24.83 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  24.76 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.8 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.97 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.97 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.01 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  25.97 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  21.94 
 
 		 450 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  22.07 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  22.13 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25.97 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  21.39 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  21.18 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  22.48 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25.19 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  23.4 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.97 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  22.2 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  26.88 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  24.72 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  23.99 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  23.99 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  23.99 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  23.99 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  23.99 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  21.72 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  21.85 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  21.82 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  24.23 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  23.5 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  24.42 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  22.58 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  26.37 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  20.6 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  23.21 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  21.3 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  20.06 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  20.9 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  20.22 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  21.75 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  18.84 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  23.76 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  26.11 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>