129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2963 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013206  Aaci_2963  Type IV secretory pathway VirB11 protein involved in flagella biosynthesis-like protein  100 
 
 
477 aa  989    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3139  hypothetical protein  24.94 
 
 
495 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0947961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0335  type II secretion system protein E  25.93 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  23.05 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  25.28 
 
 
491 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  25.37 
 
 
492 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  24.24 
 
 
476 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  25.94 
 
 
500 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  25.09 
 
 
477 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  24.05 
 
 
444 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  24.06 
 
 
498 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  24.91 
 
 
491 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  24.25 
 
 
488 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  24.52 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  24.62 
 
 
387 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0825  type II secretion system protein E  25.15 
 
 
481 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0954  type II secretion system protein E  21.96 
 
 
449 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  21.43 
 
 
492 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  22.28 
 
 
442 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  23.57 
 
 
504 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  23.15 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  25 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  22.64 
 
 
483 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  22.25 
 
 
499 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  20.36 
 
 
418 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  23.51 
 
 
508 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  24.07 
 
 
480 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  20.42 
 
 
435 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  24.62 
 
 
485 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  22.19 
 
 
521 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  23.49 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  23.26 
 
 
449 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  25.08 
 
 
395 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  24.28 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  23.6 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  23.6 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  22.43 
 
 
482 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  23.25 
 
 
464 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  22.26 
 
 
482 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  22.26 
 
 
485 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  21.89 
 
 
482 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0837  AAA ATPase  18.77 
 
 
580 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  23.37 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  23.28 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0722  type II secretion system protein E  21.1 
 
 
385 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0114  type II secretion system protein E  22.93 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  22.69 
 
 
451 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  21.53 
 
 
467 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  21.53 
 
 
433 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  21.17 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  23.51 
 
 
445 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  22.96 
 
 
454 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  21.53 
 
 
490 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  22.05 
 
 
442 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  22.56 
 
 
452 aa  50.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  24.46 
 
 
478 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  20.13 
 
 
438 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  23.61 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  22.07 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  23.79 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  21.68 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  21.9 
 
 
488 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  26.16 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  22.34 
 
 
638 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  21.17 
 
 
482 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  24.34 
 
 
431 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  23.17 
 
 
521 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  23.35 
 
 
390 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  21.53 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  21.28 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  24.46 
 
 
477 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  23.05 
 
 
624 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  21.3 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  23.86 
 
 
515 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  23.79 
 
 
328 aa  48.5  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  19.45 
 
 
414 aa  48.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3782  type II secretion system protein E  22.83 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  23.43 
 
 
594 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  23.56 
 
 
520 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  23.56 
 
 
520 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  23.56 
 
 
520 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  22.22 
 
 
513 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  23.56 
 
 
521 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  23.56 
 
 
523 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  23.56 
 
 
523 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  23.62 
 
 
569 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  20.92 
 
 
454 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  19.38 
 
 
407 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2453  type II secretion system protein E  22.05 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  22.64 
 
 
491 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0629  type II secretion system protein E  24.82 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0015  type II secretion system protein E  22.15 
 
 
644 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  20.61 
 
 
519 aa  46.6  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  20.16 
 
 
547 aa  46.6  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  23.15 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  23.48 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  22.81 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  28.16 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  21.19 
 
 
428 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>