More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0954 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0954  type II secretion system protein E  100 
 
 		 449 aa  922    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0825  type II secretion system protein E  40.41 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0335  type II secretion system protein E  33.49 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  29.43 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  28.28 
 
 		 624 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  26.84 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  27.57 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  27.3 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  26.25 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  29.21 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  27.3 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  28.18 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  27.3 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  25.55 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  30.54 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  27.88 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  28.12 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  26.83 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  28.09 
 
 		 462 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  25.38 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  28.09 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  27.47 
 
 		 594 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  24.54 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  29.9 
 
 		 638 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  25.13 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  25.13 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  27.7 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3782  type II secretion system protein E  30.2 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  28.13 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  28.12 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  28.13 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  27.94 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  27.41 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  27.73 
 
 		 639 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  28.78 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  28.53 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  27.94 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  25.76 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  25.76 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  27.11 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  27.65 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  29.9 
 
 		 634 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 608 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  27.94 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  24.94 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  26.15 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  29.12 
 
 		 563 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  29.51 
 
 		 468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  26.72 
 
 		 589 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 472 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  26.24 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  27.03 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  29.21 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  28.7 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  27.49 
 
 		 498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  26.84 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  27.01 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  25.79 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  28.86 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  29.26 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  26.11 
 
 		 450 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 483 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  29.43 
 
 		 458 aa  114  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  27.86 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  26.73 
 
 		 485 aa  113  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  28.03 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  27.79 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  27.06 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  27.89 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  26.32 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  26.71 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  26.76 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  28.7 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  27.6 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  29.38 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  25.69 
 
 		 572 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  27.52 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  26.6 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  28.89 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.77 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  29.21 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 449 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  26.87 
 
 		 495 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  27.39 
 
 		 521 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  25.37 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  25.37 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  25.63 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  27.68 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>