More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0825 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0825  type II secretion system protein E  100 
 
 		 481 aa  988    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0954  type II secretion system protein E  40.41 
 
 		 449 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0335  type II secretion system protein E  32.25 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  24.43 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  23.32 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  24.15 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  26.11 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  23.38 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  24.3 
 
 		 444 aa  97.8  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  23.24 
 
 		 438 aa  97.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  26.63 
 
 		 477 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  25.81 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  24.04 
 
 		 474 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  26.82 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  24.85 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  24.55 
 
 		 521 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  24.55 
 
 		 523 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  23.94 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  23.94 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  23.94 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  23.99 
 
 		 521 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  24.77 
 
 		 454 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  24.94 
 
 		 428 aa  90.5  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  23.94 
 
 		 515 aa  90.1  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  26.53 
 
 		 437 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  25.88 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  24.54 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  24.28 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  23.65 
 
 		 634 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  25 
 
 		 639 aa  88.6  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  23.76 
 
 		 446 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  24.06 
 
 		 458 aa  87.8  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  23.63 
 
 		 465 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  23.63 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  23.96 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  23.51 
 
 		 498 aa  87.4  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  23.96 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  22.75 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  26.33 
 
 		 569 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  24.85 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  24.11 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  23.46 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  24.26 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  25.57 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  23.35 
 
 		 638 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  24.07 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  27.51 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  24.07 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  24.07 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  26.06 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  26.06 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  23.24 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  25.07 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  26.06 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  23.24 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  23.24 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  23.8 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  22.29 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  23.63 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  22.67 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  25.17 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  23.89 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  24.44 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  25.15 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  24.71 
 
 		 563 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  25.88 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  24.17 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  24.55 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  24.17 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  24.57 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  26.56 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  23.04 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  25.07 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  23.51 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  23.51 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  23.92 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  23.54 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  24.86 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  23.35 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  24.7 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  22.71 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  23.5 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  25.63 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  23.38 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  23.68 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  23.18 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  24.17 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  26.09 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  25.07 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  22.99 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  25.23 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  23.01 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  24.56 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  27.34 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03350  hypothetical protein  27.06 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  23.39 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  23.98 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  23.95 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  23.17 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  24.72 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>