More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0629 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0629  type II secretion system protein E  100 
 
 		 481 aa  998    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  34.84 
 
 		 463 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.52 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.84 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  32.8 
 
 		 467 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  31 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 477 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  33.7 
 
 		 487 aa  174  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  35.21 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  35.44 
 
 		 521 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  31.37 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  31.37 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  31.37 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.92 
 
 		 451 aa  166  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  31.66 
 
 		 457 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  33.42 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  30.91 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  32.92 
 
 		 452 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  31.06 
 
 		 469 aa  163  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  32.09 
 
 		 624 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  34.35 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.07 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.27 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  32.68 
 
 		 498 aa  159  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  31.07 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  31.43 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  30.13 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  33.43 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  32.68 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  33.12 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  33.44 
 
 		 472 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  30.39 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  33.04 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  33.54 
 
 		 447 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  29.57 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.36 
 
 		 569 aa  156  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  30.57 
 
 		 482 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  30.11 
 
 		 521 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  33.94 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  32.16 
 
 		 445 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.93 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  30.11 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  30.11 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  30.11 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  30.11 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  30.11 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  30.27 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.05 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  30.27 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  32.92 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  35.12 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  32.17 
 
 		 454 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  29.95 
 
 		 476 aa  153  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  30.05 
 
 		 484 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  31.87 
 
 		 638 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  32.28 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  31.97 
 
 		 608 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.57 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  31.71 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  29.79 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  31.12 
 
 		 447 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  30.99 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  31.12 
 
 		 447 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  31.12 
 
 		 447 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  32.3 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  30.55 
 
 		 504 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  31.67 
 
 		 589 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  31.33 
 
 		 513 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0882  type II secretion system protein E  31.22 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  31.12 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  30.95 
 
 		 572 aa  150  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.98 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  29.67 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  29.53 
 
 		 489 aa  149  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 451 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 451 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  31.85 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.3 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  32.19 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  28.76 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  31.64 
 
 		 560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>