210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0837 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0837  AAA ATPase  100 
 
 		 580 aa  1200    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0114  type II secretion system protein E  24.73 
 
 		 514 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  23.53 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0335  type II secretion system protein E  22.26 
 
 		 452 aa  67  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0954  type II secretion system protein E  26.23 
 
 		 449 aa  67  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2222  type II secretion system protein E  23.68 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  25.97 
 
 		 445 aa  66.6  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  24.79 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  25.9 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  25.89 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  24.32 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  24.58 
 
 		 450 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  26.18 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  26.42 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  25.82 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  26.88 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  23.53 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  24.5 
 
 		 624 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  26.06 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  24.1 
 
 		 449 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  26.33 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  25.17 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  26.41 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  25 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  25.59 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  25 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  25.36 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  25.98 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  26.64 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  23.86 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  24.43 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  25.1 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  25.22 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  25.44 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  26.32 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 451 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0324  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  25.77 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  25 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  23.59 
 
 		 608 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  27.51 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 451 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  28.32 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  24.8 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  25.44 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  24.65 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  26.22 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  23.28 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  22.95 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  26.57 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  22.95 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  24.47 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  26.25 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  25.9 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  25.52 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  23.97 
 
 		 489 aa  57  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0944  type II secretion system protein E  24.4 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  23.59 
 
 		 482 aa  57  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  24.82 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  27.88 
 
 		 632 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  25.19 
 
 		 467 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  23.64 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  22.68 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.25 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  26.12 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  25.83 
 
 		 408 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  22.51 
 
 		 446 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  25.95 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  22.32 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  23.3 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  25.78 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  24.82 
 
 		 589 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  26.29 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  25.97 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  22.98 
 
 		 484 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  24.81 
 
 		 572 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  25.65 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  24.82 
 
 		 433 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  21.51 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  26.01 
 
 		 482 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  25.64 
 
 		 482 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  25.76 
 
 		 515 aa  54.7  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  23.78 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  24.82 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  22.49 
 
 		 488 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  25 
 
 		 442 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  25 
 
 		 513 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  24.1 
 
 		 477 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  23.42 
 
 		 569 aa  53.9  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  28.94 
 
 		 508 aa  53.5  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  26.52 
 
 		 523 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  26.52 
 
 		 523 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  26.52 
 
 		 521 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  23.36 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  25.61 
 
 		 638 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  26.52 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  26.52 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>