More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0114 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0114  type II secretion system protein E  100 
 
 		 514 aa  1056    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  29.38 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0335  type II secretion system protein E  25.67 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  25.81 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  27.99 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  29.67 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  27.2 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.71 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  28.65 
 
 		 491 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  27.87 
 
 		 594 aa  106  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0837  AAA ATPase  24.73 
 
 		 580 aa  106  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  27.45 
 
 		 639 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 465 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  29.02 
 
 		 569 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  28.01 
 
 		 589 aa  103  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 442 aa  103  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  27.51 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  26.2 
 
 		 432 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  27.17 
 
 		 634 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  25.53 
 
 		 449 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  25.64 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 498 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  28.32 
 
 		 521 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  26.8 
 
 		 572 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  25.87 
 
 		 474 aa  97.4  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  26.98 
 
 		 638 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 491 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  24.93 
 
 		 467 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  27.22 
 
 		 445 aa  97.1  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  28.2 
 
 		 468 aa  96.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  25.22 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  25.3 
 
 		 481 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  27.27 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  26.69 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  26.52 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  27.92 
 
 		 632 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  25.13 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  27.21 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  27.6 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  26.1 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  25.69 
 
 		 408 aa  94.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  25.91 
 
 		 483 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  25.83 
 
 		 482 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  25.94 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  26.63 
 
 		 449 aa  93.6  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  25.61 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  25.53 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  24.49 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  25.23 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  27.35 
 
 		 632 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  26.04 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  24.93 
 
 		 484 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  25.22 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  25.51 
 
 		 490 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  24.65 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  26.48 
 
 		 416 aa  92.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  25.84 
 
 		 513 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  27.49 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  24.62 
 
 		 474 aa  91.3  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  26.13 
 
 		 473 aa  90.5  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  26.06 
 
 		 624 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  24.63 
 
 		 488 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  25.44 
 
 		 504 aa  90.1  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  24.93 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  24.93 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  24.65 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  24.93 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  24.78 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  26.83 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  25.43 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  24.52 
 
 		 521 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  24.7 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  24.7 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  24.52 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  23.56 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  25.95 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  25.14 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  24.52 
 
 		 523 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  24.47 
 
 		 476 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0882  type II secretion system protein E  24.38 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  24.52 
 
 		 523 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  25 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  24.52 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  24.52 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  24.7 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  24.52 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  24.34 
 
 		 438 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  22.63 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  24.63 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  25.86 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  25.94 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  24.63 
 
 		 489 aa  87.8  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 463 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  23.48 
 
 		 472 aa  87.8  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  25.66 
 
 		 411 aa  87.4  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  25.5 
 
 		 479 aa  87  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  25 
 
 		 465 aa  87  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>